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基于酶切的简化基因组测序

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基于酶切的简化基因组测序

产品描述信息

      RADRestriction-site Associated DNA)是与限制性核酸内切酶识别位点相关的DNA。基于酶切的简化基因组测序(RAD-Seq)对酶切获得的RAD tag进行高通量测序,大幅降低基因组的复杂度,操作简便,同时不受参考基因组的限制,可快速鉴定出高密度的SNP位点。RAD-Seq基于SNP位点的分子标记技术,性价比高、稳定性好,可用于群体进化研究、遗传图谱构建、QTL定位和辅助 scaffold组装到染色体等领域。

产品详细信息

 

1、高密度、高覆盖度:获得贯穿整个基因组的高密度分子标记;

2、精确度高:采用DISR生物信息分析流程,保证SNP的高准确性;

3、性价比高:基于酶切简化的基因组DNA,数据量低,特别适合大样本量研究;

4、快速高效:只需3-4个月即可完成大样本的图谱构建或群体进化研究。

1、样品类型:DNA样品;

2、样品总量(单次):小片段文库,≥ 3μg(动植物样品),≥ 6μg(人样品);

3、样品浓度:≥ 30 ng/μL

4、样品完整性:主带清晰,无降解或轻微降解;

5、样品纯度:OD260/280 =1.8~2.0

【案例一】:运用RAD-seq技术对多年生黑麦草的亲本和193F1个体进行研究,结果鉴定了三个秆锈病抗性QTL,随后结合SSRSTS标记构建出了雌雄亲本图谱;
 

【案例二】:利用RAD技术对果蝇进行研究,在一个150kb的区域内精确地定位了一个重组断点(recombination breakpoint)。

[1]Miller MR, Dunham JP, Amores A, et al. Rapid and cost-effective polymorphism identification and genotyping using restriction site associated DNA (RAD) markers. Genome Research.2007 February; 17(2):240-248;

[2] Pfender WF, Saha MC, Johnson EA, et al. Mapping with RAD (restriction-site associated DNA) markers to rapidly identity QTL for stem rust resistance in Lolium perenne. Theor Appl Genet. 2011 May; 122(8):1467-1480.

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